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T细胞受体（TCR）主要辨别由主要组织相容性复合物（MHC）分子提呈的肽段。这类肽段一般源自被处置过的蛋白质抗原，可以是体内自己蛋白或外来入侵者如病毒、细菌等产生的蛋白。具体来讲，CD4T辅助细胞辨别与MHC II类分子结合的外源性抗原肽，而CD8细胞毒性T淋巴细胞则辨别与MHC I类分子结合的内源性抗原肽。这种特异性辨别是适应性免疫应答中的重点步骤之一，能够帮助激活T细胞并启动针对特定病原体的免疫反应。
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