肠球菌和奈瑟菌是两种不一样的细菌，它们在临床诊断中具备关键的意义。为了正确地辨别这两种细菌，知道它们之间的生化差异是很必要的。
1. 形态学特点：肠球菌为革兰氏阳性球菌，一般成对或短链状排列；而奈瑟菌则为革兰氏阴性双球菌，容易见到于成对排列。这一特质在初步辨别时具备肯定的参考价值。
2. 生化反应：
| 肠球菌：肠球菌可以水解胆汁七叶苷（Bile Esculin Test），这是其一个典型的生化特点；同时，它们可以耐受6.5%的NaCl环境。除此之外，肠球菌对甲氧西林敏锐性试验呈阴性。
| 奈瑟菌：奈瑟菌不可以水解胆汁七叶苷，但可以氧化酶阳性（Oxidase Test），这是辨别奈瑟菌的一个要紧标志；另外，大部分奈瑟菌能借助葡萄糖和麦芽糖产生酸而不产气。
3. 抗生素敏锐性：肠球菌对抗生素如青霉素、氨苄西林等表现出不一样的敏锐度。而奈瑟菌对多种抗生素敏锐，比如青霉素G、头孢曲松等。
4. 培养条件：在血平板上培养时，肠球菌可形成圆形、光滑、边缘整齐的小菌落；奈瑟菌则需要愈加丰富的营养基质（如巧克力琼脂），并且在35|37℃条件下成长好。
通过上述生化试验及形态学察看等办法可以有效区域分这两种细菌。但在实质工作中，为了确保结果的准确性，总是还需要结合其他测试方法进行综合判断。
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