氨基糖苷类抗生素是临床上常见的一类抗生素，但其具备多种毒性，具体如下：
耳毒性是氨基糖苷类抗生素较为突出的毒性之一。它可分为前庭功能失调和耳蜗神经损害。前庭功能失调表现为眩晕、恶心、呕吐、眼球震颤和平衡障碍等。这是由于药物会损害内耳的前庭器，影响人体对平衡和空间地方的感知。耳蜗神经损害则主要致使耳鸣、听力衰退甚至永久性耳聋。药物会损伤内耳的毛细胞，而毛细胞一旦受损，非常难再生，从而导致不可逆的听力损失。儿童和老年人对耳毒性更为敏锐，特别是儿童，或许会因听力障碍影响语言学习和社交能力。
肾毒性也是容易见到的不好的反应。氨基糖苷类抗生素主要经肾脏排泄，并且可在肾脏皮质内蓄积。药物会损害肾小管上皮细胞，致使蛋白尿、管型尿、血尿等，紧急时可引起氮质血症、肾功能衰退。这是由于药物影响了肾小管的重吸收和分泌功能，破坏了肾脏的正常结构和功能。肾功能不全者用该类药物时，肾毒性的发生率会更高，且或许会加重原有些肾脏疾病。
神经肌肉阻滞用途是氨基糖苷类抗生素较为紧急的毒性反应。它可引起心肌抑制、血压降低、肢体瘫痪和呼吸衰竭等。这是因为药物与突触前膜上的钙结合部位结合，阻止钙离子参与乙酰胆碱的释放，致使神经肌肉接头处的信号传递受阻。这种毒性反应在大剂量静脉迅速注射或与肌肉松弛药适用时更容易发生。
除此之外，氨基糖苷类抗生素还可能引起过敏反应，如皮疹、发热、血管神经性水肿等，紧急时可出现过敏性休克。少数病人还可能出现血象变化、肝酶升高、面部及四肢麻木、周围神经炎等不好的反应。在用氨基糖苷类抗生素时，需要密切关注这类毒性反应，权衡利弊，小心用药。
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