免疫球蛋白具备多种关键的主要功能，在机体的免疫防御、免疫自稳和免疫监视等过程中发挥着重点用途。
第一是辨别并特异性结合抗原，这是免疫球蛋白最基本的功能。抗体与抗原结合后，可在体内介导多种生理和病理效应，如中和细菌外毒素，使其失去毒性用途；中和病毒，阻止病毒吸附和侵入易感细胞，从而保护机体免受病原体的侵害。在体外，也可借助这一特质进行免疫诊断，如各种凝集试验、免疫比浊等。
第二是激活补体，IgM、IgG1、IgG2和IgG3与相应抗原结合后，可通过经典渠道激活补体系统，产生多种生物学效应，如溶解靶细胞、调理吞噬等。IgA、IgG4等还可通过替代渠道激活补体，增强免疫防御能力。
再者，免疫球蛋白可以结合细胞表面的Fc受体，不相同种类型的免疫球蛋白可与不同细胞表面的Fc受体结合，产生不一样的生物学效应。譬如IgG可与巨噬细胞、中性粒细胞表面的Fc受体结合，增强吞噬细胞的吞噬用途，即调理吞噬；IgE可与肥大细胞和嗜碱性粒细胞表面的Fc受体结合，使这类细胞致敏，当相同变应原第三进入机体时，可引发Ⅰ型超敏反应。
另外，免疫球蛋白还参与抗体的转运，IgG是唯一能通过胎盘的免疫球蛋白，这对于新生儿抗感染具备要紧意义，使新生儿在出生后的一段时间内获得被动免疫保护。分泌型IgA可通过呼吸道、消化道等黏膜表面，在黏膜局部抗感染中发挥要紧用途。
最后，免疫球蛋白还参与免疫调节，体内多种细胞均有免疫球蛋白的Fc受体，免疫球蛋白与相应抗原结合后，通过Fc段与这类细胞表面的Fc受体结合，可调节细胞的活性，对免疫应答进行正负调节，保持机体内环境的稳定。
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