补体的激活渠道主要有三条，分别是经典渠道、旁路渠道和甘露糖结合凝集素（MBL）渠道。
经典渠道的激活物主如果抗原 | 抗体复合物，当抗体（IgM、IgG1、IgG2、IgG3）与抗原结合后，抗体构象发生改变，暴露出补体 C1q 结合位点，C1q 与之结合并被激活，依次激活 C1r、C1s，形成具备丝氨酸蛋白酶活性的 C1 酯酶。C1 酯酶可裂解 C4 和 C2，形成 C4b2b 复合物，即 C3 转化酶，C3 转化酶可将 C3 裂解为 C3a 和 C3b，C3b 与 C4b2b 结合形成 C4b2b3b，即 C5 转化酶，启动后续的补体级联反应。经典渠道在感染后期或二次感染中发挥要紧用途，是适应性免疫应答的要紧效应机制。
旁路渠道的激活物是细菌的脂多糖、酵母多糖、凝聚的 IgA 和 IgG4 等。在生理状况下，C3 可自发水解产生 C3b，C3b 与 B 因子结合，在 D 因子有哪些用途下，使 B 因子裂解为 Ba 和 Bb，形成 C3bBb，即旁路渠道的 C3 转化酶。C3bBb 可与 P 因子结合，使其稳定性增强。C3bBb 进一步结合 C3b 形成 C3bBb3b，即旁路渠道的 C5 转化酶。旁路渠道无需抗体参与，在感染早期即可发挥用途，是固有免疫的要紧组成部分。
MBL 渠道的激活物是病原体表面的甘露糖、岩藻糖等糖结构。在感染早期，肝脏合成并分泌的 MBL 可辨别并结合病原体表面的糖结构，激活与之相连的 MBL 有关丝氨酸蛋白酶（MASP）。MASP 具备与 C1r、C1s 类似的活性，可裂解 C4 和 C2，形成 C3 转化酶，后续过程与经典渠道相同。MBL 渠道也不依靠抗体，在固有免疫防御中具备要紧意义。
这三条补体激活渠道相互联系、相互补充，一同构成了补体系统的
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