沙门氏菌属是一大群寄生于人类和动物肠道内、生化反应和抗原架构一样的革兰氏阴性杆菌，依据不一样的分类标准可分为不相同种类型。
从生化分类角度来看，沙门氏菌属可分为肠道沙门氏菌和邦戈尔沙门氏菌。肠道沙门氏菌又可进一步细分，它包括了很多在临床上较为容易见到的血清型。
而依据抗原结构进行分类，这是更为常见的分类办法。沙门氏菌具备三种主要抗原，即菌体抗原（O抗原）、鞭毛抗原（H抗原）和表面抗原（Vi抗原）。依据O抗原的不同，可将沙门氏菌分为42个群；再结合H抗原的差异，又能进一步区别出约2500个血清型。在海量血清型中，能引起人类疾病的血清型主要集中在A | E群。比如，伤寒沙门氏菌、甲型副伤寒沙门氏菌、肖氏沙门氏菌（原称乙型副伤寒沙门氏菌）和希氏沙门氏菌（原称丙型副伤寒沙门氏菌），它们主要引发肠热症，是较为特殊的种类，侵袭人体后会致使发热、全身不适、相对缓脉等一系列的表现。除去这类引起肠热症的种类外，还有很多其他血清型沙门氏菌，它们主要通过污染食物等渠道，引发食物中毒，致使恶心、呕吐、腹痛、腹泻等胃肠道的表现。另外，还有一些沙门氏菌可引起败血症，多见于儿童或免疫力低下人群，病情相对较为紧急。
综上所述，沙门氏菌属的分类方法多样，不相同种类型在致病性、引发的临床的表现等方面存在差异。
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